当海事海商案件海事法院作出生效判决后，根据当事人的申请，海事法院经审核会启动海事案件执行程序。执行程序会将已经扣押的船舶或者其他财产进行拍卖、变卖以给付申请人经生效法律文书所确认的合法债权。
一、执行案件管辖
海事案件的执行应当由做出生效法律文书的一审法院管辖（《民事诉讼法》第二百二十四条），申请人有保全的由裁定保全的海事法院管辖。申请执行仲裁裁决的，向被执行人财产所在地海事法院提出，被执行人财产所在地没有海事法院的，向被执行人财产所在地或居住地中级人民法院提出（《海事诉讼特别程序法》第十一条）；
二、申请强制执行的时效
申请执行的期间为两年，适用诉讼时效中止、中断的规定。（《民事诉讼法》第二百三十九条）
三、拍卖船舶的通知
船舶作为债务人的主要财产，可能会设立船舶抵押权、船舶优先权或是船舶留置权，其处理比较特殊。海事法院审查海事请求人的申请后裁定是否准许，裁定准许的，应通过报纸及其他媒体发布拍卖公告，拍卖外籍船舶的，还应通过对外的媒体发布公告，公告内容当包括船名、船籍、拍卖的依据、时间、地点等主要信息。船舶优先权人、抵押权人、所有人在拍卖船舶的30日前另行通知。（《海事诉讼特别程序法》第三十条至第三十三条）；
四、船舶拍卖的程序
拍卖船舶由拍卖船舶委员会实施。拍卖船舶委员会由海事法院指定的本院执行人员和聘请的拍卖师、验船师三人或者五人组成。拍卖船舶委员会组织对船舶鉴定、估价；组织和主持拍卖；与竞买人签订拍卖成交确认书；办理船舶移交手续。拍卖船舶委员会对海事法院负责，受海事法院监督。竞买人应当在规定的期限内向拍卖船舶委员会进行登记，并提交相关主体证明手续和委托代理手续，缴纳买船保证金。在拍卖船舶前拍卖船舶委员会应当向竞买人展示船舶，竞买人可以查看被拍卖船舶的相关数据、配置和其他有关资料。买受人签署成交确认书后，支付拍卖价款，可全款，可按揭，具体要看拍卖委员会和买受人的约定。买受人按照约定付款后，拍卖委员会组织移交。移交完毕，海事法院负责解除船舶扣押。
